相互易位杂合体只有在减数分裂过程中通过交互离开所形成的平衡配子才能够存活，并使非同源染色体上的基因显示假连锁现象（见染色体畸变)。所以把带有属于已知染色体的标记基因的相互易位品系作为测交品系和一个突变型品系杂交，如果发现这一突变基因经常和标记基因的野生型等位基因相连锁，就可以判定突变基因一定在相互易位的两个染色体中的一个上面。例如在粗糙脉孢菌中有一个品系（图1)，它的第 Ⅰ染色体上带有白色分生孢子基因（albino,al），第Ⅳ 染色体上带有温度敏感的蔓延菌落基因(colonial temperature sensitive,cot)，第Ⅵ染色体上带有黄色分生孢子基因(yellow conidia,ylo)，同时它还是染色体Ⅰ－Ⅱ、Ⅳ－Ⅴ和Ⅲ－Ⅵ相互易位品系。用它作为测试菌株和任何一个突变型菌株进行杂交，就可以通过一次杂交大致上测得这一突变型所属的染色体。例如具有这一突变性状的杂交子代菌株总是菌丝蔓延的，就知道它的突变基因属于染色体Ⅳ或Ⅴ。又假如这个突变型和al、cot和ylo都没有连锁关系，那么由于粗糙脉孢菌只有7个染色体，就可以推测这一突变基因在染色体Ⅶ上。
基因定位方法介绍假连锁法
